故事发生在椚丘中学三年E班，外观上，这是一个普通的班级，然而现实上，这里群集着的均是技艺高超冷漠无情的杀手。每一年，他们经由特别渠道领受着来自世界各地的暗算任务，替各国领袖“排忧解难”，而这一次，他们有了一个统一的目标——刺杀班主任杀先生（福山润 配音）。杀先生是一个神奇的存在，它的外表并非人类，却有着及其敏感的神经和及其迅速的反应力，没有人知道它从哪里来，也没有人知道，它为何会酿成三年E班的班主任。因为想要扑灭地球，杀先生成为了暗算名单上的高价悬赏人物，而作为三年E班的学生，只要成功消灭杀先生，即可卒业。就这样，环绕着这位神奇的先生，布满了危险的日常就此展开。